[過去ﾛｸﾞ] 数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス (1002ﾚｽ)
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672(3): 2020/06/09(火)09:32 ID:olJVeaWc(1/4) AAS
ここ数日流れている、7割の人は誰にもうつさないの元論文。
外部ﾘﾝｸ:www.researchsquare.com
figure2Bが個人の再生産数の分布で、負の二項分布で近似可
673(1): 2020/06/09(火)10:15 ID:vlglV9Ra(1/2) AAS
>>672
abstract読んだだけではわからんかった。
どういうことか詳しくお願い。
ってか、そういうのも考慮にいれて実効再生産数の値が決まるんでは？
681(2): 2020/06/09(火)23:46 ID:Rz+Wm47s(1) AAS
>>672
理論的根拠があって負の二項分布を選んだのかと思って読んでみたらRであてはまりのよい分布を探したみたい。
Calculation of serial interval and empirical offspring distribution
We calculated the median serial interval as the difference between the symptom onset dates of each infector-infectee pair, excluding asymptomatic cases, and fitted normal, lognormal, gamma and Weibull distributions using the R package “fitdistrplus" and maximum-likelihood methods, excluding eight non-positive data points for the latter three distributions.
We generated the empirical offspring distribution from the observed number of secondary cases per individual infector and similarly fit negative binomial, geometric and Poisson distributions as before.
750(1): 2020/07/05(日)13:11 ID:rpUuAKzr(2/3) AAS
>672のデータ
外部ﾘﾝｸ:www.researchsquare.com
From the empirical offspring distribution and
fitted negative binomial distribution shown in Figure 2B,
we estimated an observed reproductive number (R) of 0.58 (95% CI: 0.45 - 0.71)
and dispersion parameter (k) of 0.45 (95% CI: 0.31 - 0.76).
を使って乱数発生させてシミュレーションしてみた。
省28
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