[過去ﾛｸﾞ] 数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス (1002ﾚｽ)
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207(2): 2020/04/05(日)09:54 ID:fV/kgtmE(1/2) AAS
オリンピック延期決定以後の東京都の行政PCR検査での陽性率をグラフにすると
画像ﾘﾝｸ[png]:i.imgur.com
（陽性数より検査件数の公表は２〜３日遅れる）
PCR検査は感度60％、特異度90％くらいなので検査を受けた集団の有病率はもっと多いはず。
感度(最頻値0.6 標準偏差0.1)、特異度（最頻値0.9 標準偏差0.05)のベータ分布に設定、有病率は(0,1)の一様分布でMCMCしたみた。
画像ﾘﾝｸ[png]:i.imgur.com
有病率40％くらいありそうだな。
210(1): 2020/04/06(月)01:00 ID:taqqH9Ce(1/3) AAS
>>207
疑い例だけに絞って検査してるんだから、有病率が高いのは当たり前。
検査を拡大すれば感染者数は増えるが、有病率はぐっと下がるだろう。
215: 2020/04/06(月)22:07 ID:Sgr4CLg/(1) AAS
>>207
東京都は陽性者数は公表しても検査人数を迅速に公表しないのでRのパッケージAmeliaを使って多重代入法による欠測データ処理してみる。
#
subjects=c(74,95,87,143,244,330,41,145,164,469,NA,NA,NA)
positives=c(17,41,47,40,63,68,13,78,66,97,89,117,143)
(dataset=data.frame(subjects,positives))
# 検査実施人数を欠測データとしてAmeliaで推定
省16
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