[過去ﾛｸﾞ] 数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス (1002ﾚｽ)

数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス http://rio2016.5ch.net/test/read.cgi/math/1582910321/

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692: １３２人目の素数さん [sage] 2020/06/16(火) 10:25:31.57 ID:IaE5USJ0 厚労省がやってた抗体検査も結果出た。 https://www.mhlw.go.jp/content/10906000/000640184.pdf http://rio2016.5ch.net/test/read.cgi/math/1582910321/692

693: １３２人目の素数さん [sage] 2020/06/16(火) 12:01:44.37 ID:RYoHf/j0 >>692 ロッシェとアボトットという業界では一流ブランドなのに一致率が低いのに驚き TYO=matrix(c(2,4,2,1963),2,b=T) > OSA=matrix(c(5,5,11,2949),2,b=T) > MYA=matrix(c(1,6,2,3000),2,b=T) > (dat=TYO+OSA+MYA) [,1] [,2] [1,] 8 15 [2,] 15 7912 > library('epiR') > epi.kappa(dat) $prop.agree obs exp 1 0.9962264 0.9942306 $pindex est se lower upper 1 -0.9942138 0.0008513625 -0.9958825 -0.9925452 $bindex est se lower upper 1 0 0.0008518883 -0.00166967 0.00166967 $pabak est lower upper 1 0.9924528 0.9892346 0.9949051 $kappa est se lower upper 1 0.3459338 0.01121544 0.323952 0.3679157 $z test.statistic p.value 1 30.84442 6.655295e-209 $mcnemar test.statistic df p.value 1 0 1 1 http://rio2016.5ch.net/test/read.cgi/math/1582910321/693

696: １３２人目の素数さん [sage] 2020/06/16(火) 13:24:20.56 ID:RYoHf/j0 >>692 多重比較になるけど、補正なしでも都市間の有意差はでないね。 むしろ、有名メーカーの検査キットの不一致の方が意外だった。 > positives=c(TYO=2,OSA=5,MYA=1) > subjects =c(TYO=1971,OSA=2970,MYA=3009) > pairwise.prop.test(positives,subjects,p.adjust.method = 'none') Pairwise comparisons using Pairwise comparison of proportions data: positives out of subjects TYO OSA OSA 0.82 - MYA 0.71 0.21 P value adjustment method: none Warning messages: 1: In prop.test(x[c(i, j)], n[c(i, j)], ...) : Chi-squared approximation may be incorrect 2: In prop.test(x[c(i, j)], n[c(i, j)], ...) : Chi-squared approximation may be incorrect 3: In prop.test(x[c(i, j)], n[c(i, j)], ...) : Chi-squared approximation may be incorrect > library(fmsb) > pairwise.fisher.test(positives,subjects,p.adjust.method = 'none') Pairwise comparisons using Pairwise comparison of proportions (Fisher) data: positives out of subjects TYO OSA OSA 0.71 - MYA 0.57 0.12 P value adjustment method: none http://rio2016.5ch.net/test/read.cgi/math/1582910321/696

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