[過去ﾛｸﾞ] 数学 統計に詳しい人が語るコロナウイルス (1002ﾚｽ)
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424: 2020/04/28(火)10:03 ID:/p2virDs(1) AAS
外部ﾘﾝｸ:www.researchgate.net
画像ﾘﾝｸ[png]:i.imgur.com
に有病率の低い群で行った唾液と鼻咽頭スワッブ200例のcross-section tableがあったので
これでKappa係数とPABAK（prevalence ad-justed bias adjusted kappa）とその信頼区間をstanのMCMCで出してみた。
swabと唾液でまあ、結果が合致している。

> print(fit.kappa,pars=c('kappa','PABAK'))
Inference for Stan model: kappa.
4 chains, each with iter=2000; warmup=1000; thin=1;
post-warmup draws per chain=1000, total post-warmup draws=4000.

mean se_mean sd 2.5% 25% 50% 75% 97.5% n_eff Rhat
kappa 0.81 0 0.07 0.65 0.77 0.81 0.86 0.92 3540 1
PABAK 0.93 0 0.02 0.88 0.92 0.93 0.95 0.97 3342 1

JAGSでMCMCしてもほぼ同じ結果。
画像ﾘﾝｸ[png]:i.imgur.com

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