[過去ﾛｸﾞ] Message Passing Interface (MPI) 統合スレ (547ﾚｽ)
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539: 2017/08/25(金)02:38 ID:LiutTzVc(1/2) AAS
OpenMPIを使うコードがinfinibandがある環境がない環境に比べ滅茶苦茶遅くて困った。
プロファイルとって調べたらopal_memory_ptmalloc2_int_mallocが一番時間食っていた。
コミュニケータは作るものの通信を一切しないテストコードなのにOpenMPIのmalloc系の関数が
何故に出てくんのかと思ったら、これglibcのmallocをフックしちゃうやつなのね。
mpirunに「--mca mpi_leave_pinned 0」を付けると無効化できて速度が元に戻ったけど、
このmpi_leave_pinnedはinfinibandのようなRDMA対応ネットワークのための設定なのに
有効化すると逆に遅くなるのが解せない・・・。
540(1): 2017/08/25(金)03:05 ID:LiutTzVc(2/2) AAS
ググって見つけた論文「HPCクラウドの実現に向けた仮想化クラスタの性能評価」には
Infiniband使用時にMPI集団通信を向上させるために、実行時オプションとして
「--mca mpi_leave_pinned 0」を付加した
って記述があるが、OpenMPIのFAQによればそれだとメモリをpinできないので遅くなるはず。
結局Infinibandを正しく使うにはどう設定するべきなんだろうか・・・。
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