[過去ﾛｸﾞ] 【スパコン】理研、創薬専用スパコン開発 「RISC-V」アーキテクチャ採用、10万原子の挙動再現[11/19] (74ﾚｽ)
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1(1): サンダージョー ★ 2019/11/20(水)17:02 ID:CAP_USER(1) AAS
2019年11月19日 19時32分
https://www.itmedia.co.jp/news/articles/1911/19/news135.html
理化学研究所は11月18日、水やタンパク質など分子の動きのシミュレーションに特化した専用計算機「MDGRAPE-4A」を開発したと発表した。1秒間に約1300兆回（1.3ペタフロップス）の計算が可能で、タンパク質と薬剤、水分子などを合わせた計10万個の原子の動きを、現実的な時間で解析できる。「創薬の可能性を広げるもの」と理研は期待を掛ける。
https://image.itmedia.co.jp/news/articles/1911/19/ki_1609376_riken01.jpg
理研の研究チームは、原子間に働く力の計算に特化したアルゴリズムと専用ハードウェアを開発。専用計算のプロセッサには、オープンソースのアーキテクチャ「RISC-V」を採用した。「RISC-Vをベースとする実用大規模システムとしては世界初」（理研）という。
分子動力学による高精度シミュレーションの例。リボン状の物体がタンパク質で、球が連なる物体が薬の分子
https://image.itmedia.co.jp/news/articles/1911/19/ki_1609376_riken02_w390.jpg
これにより、汎用のスパコンではこれまで計算に1年3カ月掛かっていた10万個の原子の100マイクロ秒間のシミュレーションを、3カ月に短縮できるとしている。
省5
2(1): ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:15 ID:R9C4gBI5(1) AAS
>>1
Grape系は日本的なコンピュータで単一目的に特化した計算デバイス。
だからtop500にはランギンクしない。
でも、今汎用性を放棄した計算機を作成することのメリットはよくわからなんな。
製薬なら、メガファーマーは多数のスパコン用意してやってる。
3: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:22 ID:cRu+YkgI(1) AAS
ランギンク
4: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:39 ID:uHn6axmB(1) AAS
３ヶ月かぁ・・
夜仕掛けて朝回収できるくらいにならないかなぁ・・
5: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:40 ID:OXFfc7Rm(1) AAS
ジャップはわかめスープ会社頼りかw
6: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:40 ID:ofNrer/9(1) AAS
あれ、arm使ってる奴はどこに
7: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:46 ID:L9aRXrfd(1) AAS
化学反応をシミュレーションだけで再現とか無理じゃね？
シュレーディンガー方程式は水素原子以外解けないんだし
8(1): ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)17:51 ID:h4yLSW00(1) AAS
スパコンはＡＲＭだし、今度はＲＩＳＣ−Ｖかよ
ちゃんと統一しろよ。
つーか、自分達でアーキテクチャぐらい作れよ。
研究の根幹になる事だぞ。
9(1): ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)18:27 ID:qdcYsSUc(1) AAS
もっとシステムの規模を大きくしたときに性能がスケールするんだろうか？
10(1): ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)18:30 ID:HAu6esHs(1) AAS
製薬会社以外に買うとこあるん？
11: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)18:50 ID:BWWhZ1qh(1/2) AAS
ハゲ完全に嵌め込まれたな＾＾；
山ほどプロセッサを使うスパコンにライセンス料を取るARMなんか使えない
12: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)19:07 ID:BWWhZ1qh(2/2) AAS
ああコレってグレープの子孫にあたるコンピュータなのか＾＾；
昔、「手作りスーパーコンピュータへの挑戦」っていう本で読んだことがあるわ
アキバで買って来た部品を使って２０万円だかで
天文シミュレーション用のスパコン（グレープ初号機）を作ったという内容だった
13(1): ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)19:28 ID:srWIUamn(1) AAS
某EDAベンダーのセミナーで聞いたことがあるが、マニアックな専用命令が必要になり、
RISC-Vをベースに命令追加やパイプライン最適化等の拡張したとか。
まともにHDLで設計したら大変なんだけど、そのEDAベンダーのツールを使うことで効率よく開発できた、って話だった。
14: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)19:47 ID:P8jwGSYh(1) AAS
国際金融資本はrisc-vへの移行を決定していた
armはロスチャイルド系企業
将来性が無いお荷物企業armを高値でハゲに買わせたゴールドマンサックスもロスチャイルド企業
ハゲはまんまと嵌められたんだよ
15: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)19:52 ID:iFF/DG6e(1) AAS
逮捕されてたやつの後継か
16: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)22:49 ID:B2FH9ZXp(1) AAS
RISC-Vって流行ってるね。
おれもCPU作ってみたい
17: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)23:07 ID:wb+oSr+8(1) AAS
詐欺集団ｗ
18: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)23:26 ID:wpF4tA8f(1) AAS
エクサクラスの計算機も、もうすぐだな
19: ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)23:46 ID:NJ0tuSck(1) AAS
アーキテクチャーの種類は技術系にとってはどうでもよくて、
ライセンス料とかの影響が大きいからな。
今後普通にRISC-Vになるんじゃなかろうか？
20(1): ニュースソース検討中＠自治議論スレ 2019/11/20(水)23:48 ID:2vCONSaK(1) AAS
オプソのCPUって使い物になるのこれくらいしかないもんな
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