[過去ログ] 【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★] (415レス)
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(19): 田杉山脈 ★ [] 2020/07/06(月) 21:50:34 ID:CAP_USER(1)
理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。

 奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。

 さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
外部リンク[html]:pc.watch.impress.co.jp
2: [] 2020/07/06(月) 21:51:21 ID:AfB/3SGH(1)
謎の女子高生の正体は? 45年前に撮影されたモノクロ写真がカッコよすぎる
外部リンク[html]:www.show-beauty.myddns.com
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(3): [] 2020/07/06(月) 21:51:23 ID:cpKvbWaA(1)
俺にも使わせてくれ
ソシャゲが快適にプレイできるか試したい
4: [sage] 2020/07/06(月) 21:55:07 ID:/0qWIPOR(1)
さすがARMの高性能CPUはすごいな
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(11): [sage] 2020/07/06(月) 21:59:35 ID:Z2K7oqhZ(1)
多けりゃいいってモンか?
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(1): [] 2020/07/06(月) 22:00:31 ID:nFc+VITg(1)
今は分子動力学計算でそんなことまで解るようになったんだな
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(2): [] 2020/07/06(月) 22:03:02 ID:1AH0K0iO(1)
ちなみに、富岳の最寄り駅は「京コンピュータ前駅」だぜ
京はもう無いけど、駅名を変えるにはスゲー金かかるから、当分このままらしい
8: [] 2020/07/06(月) 22:03:12 ID:7IYd1u14(1)
>>3
意外と出来ないと思うぞ
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(1): [sage] 2020/07/06(月) 22:04:54 ID:jORb0OlU(1)
分子動力学計算はgrapeの方が計算速いはずだけど、ARMベースのほうがプログラム構築が汎用的で使いやすいのかな。
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(1): [] 2020/07/06(月) 22:05:03 ID:Q5OMRiJV(1)
登山漫画の最高峰
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(1): [] 2020/07/06(月) 22:05:39 ID:sDW1jynz(1)
>>5
レンポーさんご苦労さん
2位じゃダメみたいですね
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(1): [] 2020/07/06(月) 22:06:37 ID:1g63xeLY(1)
富嶽もARM系だってな!
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(1): [] 2020/07/06(月) 22:07:21 ID:3RXWDITC(1)
馬鹿パヨ早速歯軋りw
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(3): [sage] 2020/07/06(月) 22:07:30 ID:SB6CTMjf(1)
おれが死ぬ確率と死ぬXデーの予測してくれ
15: [] 2020/07/06(月) 22:08:04 ID:xWGlDrgE(1)
富嶽で使われるARMは、AmazonのAWSにも使われているよ。
16: [] 2020/07/06(月) 22:08:50 ID:svClXDTx(1)
でも明日の天気すら当たらないんだろ。
アホみたいに被害も出てるし何の役にも立たない。
17: [] 2020/07/06(月) 22:09:09 ID:t7vAEC5j(1)
臨床試験もバーチャルでできないの?
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(1): [] 2020/07/06(月) 22:09:14 ID:IAsaYLDT(1)
新薬ができるのは早くて2,3年だろうね。
順調に行けば5年ってとこ
それまでは代用品でだな
19: [sage] 2020/07/06(月) 22:09:18 ID:4gbHHukk(1)
税金で飯食ってる世界中の二重国籍者の分析をお願いいたします
20: [] 2020/07/06(月) 22:09:20 ID:1E8UAD1S(1/2)
で、実際の医療現場で薬使えるようになるのはいつなんだい?
21: [sage] 2020/07/06(月) 22:09:31 ID:ktPFsPJ+(1)
x=rnd(0)
22: [sage] 2020/07/06(月) 22:10:16 ID:FCdKzH+l(1)
>>10
中島の新型超重爆撃機だぞ

朝鮮人w
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(2): [] 2020/07/06(月) 22:10:29 ID:QbtQfM3H(1)
これも結局一年もするとアメリカに簡単に抜かれるだろう
GPGPUだとこの半分の予算で倍の性能になる
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(2): [sage] 2020/07/06(月) 22:10:30 ID:EnnTwFM9(1/2)
2000種類って多過ぎね?
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(3): [] 2020/07/06(月) 22:11:34 ID:bS9f5ADD(1/2)
>>1
富岳って対コロナ用に前倒しで実戦配備されたんだよな
ガンダムみたいだな ガンガレ!
26: [sage] 2020/07/06(月) 22:12:54 ID:/qi0ZBX3(1)
これで新型コロナを作ればいいわけか
27
(1): [] 2020/07/06(月) 22:13:25 ID:dbhLOVRn(1)
 

2000も出せば何個かあたって当たり前。

 
28: [] 2020/07/06(月) 22:13:31 ID:v377R+CF(1)
ガスター10で、乗り切るから余裕
29: [] 2020/07/06(月) 22:14:22 ID:sb3G0B34(1)
くそきな臭すぎてレンホー応援したくなるレベル
30: [sage] 2020/07/06(月) 22:14:39 ID:hzuHVl89(1)
ハゲ治療薬がやっと完成する?
31
(1): [] 2020/07/06(月) 22:14:44 ID:in4rXIyi(1)
いや1種類を選別するならまだしも2000種ってどでもいいだろ
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(3): [] 2020/07/06(月) 22:15:01 ID:5WqN0ntI(1)
>>25
富岳「待たせたな」
33: [] 2020/07/06(月) 22:16:30 ID:bS9f5ADD(2/2)
>>32
京が1年掛かる計算を数日でできるらしいからな
21年始動を1年近く前倒ししたとか浪漫すぎる
34: [sage] 2020/07/06(月) 22:17:40 ID:EnnTwFM9(2/2)
1種類でも年単位で試験するのに2000種類も試験してたら
いつ出来るのやら。

2位のスパコンで良いんじゃね?
35: [] 2020/07/06(月) 22:19:44 ID:9i/mAyrD(1)
公務員大量解雇時代到来消費税なくなるぞ
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(1): [sage] 2020/07/06(月) 22:20:44 ID:zwj0mO+G(1)
>>5
もうちょっと絞って欲しいよな
37: [] 2020/07/06(月) 22:23:10 ID:Uz/qnD6W(1/2)
>>36
絞ってるぞ
トップ10くらい以外はゴミみたいな効果しかなさそーって
グラフがあったしそれミロ
38: [] 2020/07/06(月) 22:24:21 ID:TwvxQ4Q8(1)
凄えな富嶽。この調子であと一カ月もすれば、
どんな薬でもコロナに効くことが判明するのでは?
39
(1): [sage] 2020/07/06(月) 22:24:31 ID:H0cRu6Fy(1)
ウンコを入れればウンコが出てくる
それがデータサイエンス

そんな方法で今までどんだけ失敗してきたか
スパコンになっても手法が糞なら糞しか出ないね
40
(2): [] 2020/07/06(月) 22:25:01 ID:deOhSO6b(1)
別に富岳じゃないとできないわけじゃないんじゃないの?
41
(1): [] 2020/07/06(月) 22:25:32 ID:4mMaDjNE(1/2)
>>3
富岳の計算能力は大体スマホ3000万台分
42: [] 2020/07/06(月) 22:28:22 ID:Uz/qnD6W(2/2)
>>40
i7のCPU一個でも可能だが何万年もかかるというわけ
43: [sage] 2020/07/06(月) 22:29:02 ID:wR2xIpx9(1/4)
自慢にはならない
44: [sage] 2020/07/06(月) 22:30:02 ID:F6x0oXEo(1)
仮想化して分散処理させた計算とどう違うの?
45
(1): [] 2020/07/06(月) 22:30:19 ID:ncbxTIVS(1)
他国のスパコンだってその位やってるだろう

ぶっちぎりの1位でもないのに
46
(1): [] 2020/07/06(月) 22:31:55 ID:3QG/wvVV(1)
>>1
俺なら2000どころか、もっと挙げてみせるぜ
10倍くらいいけるな
47: [] 2020/07/06(月) 22:32:28 ID:4mMaDjNE(2/2)
>>45
今はぶっちぎりの一位
そして4種類のベンチマーク全てでの一位(4冠)は史上初
48: [sage] 2020/07/06(月) 22:32:31 ID:N8Jd+OdJ(1)
富岳チューニングするための丁度良いデータ取りになるからこいつじゃないと意味ないだろうし
ガンガン使って使い勝手上げてほしいものだね
49: [sage] 2020/07/06(月) 22:34:48 ID:JRgHFmVx(1/3)
>>5
判定対象が数千種類あって、それを10日で処理したんだろ
なるべく多くを短時間で処理できた方がよかろうよ
50
(1): [sage] 2020/07/06(月) 22:36:01 ID:JRgHFmVx(2/3)
>>46
そこから可能性ありと抽出されたのは数十種
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