STAP細胞の懐疑点 PART465

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8:  名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/06/20(金) 21:19:44.85

ＳＴＡＰ問題 冷凍庫に「ＥＳ」容器 (2014年6月16日)
http://www3.nhk.or.jp/news/html/20140616/k10015263331000.html
http://megalodon.jp/2014-0616-2110-06/www3.nhk.or.jp/news/html/20140616/k10015263331000.html

> 理化学研究所の小保方晴子研究ユニットリーダーらが使っていた研究所内の冷凍庫から
> 「ＥＳ」と書かれたラベルを貼った容器が見つかり、中の細胞を分析したところ、共同
> 研究者の若山教授の研究室で保存されていたＳＴＡＰ細胞を培養したものだとする細胞
> と遺伝子の特徴が一致したとする分析結果がまとまっていたことが分かりました。
>
> 理化学研究所の関係者によりますと、分析結果をまとめたのは、小保方リーダーが所属
> する神戸市の理化学研究所発生・再生科学総合研究センターの研究者らのグループです。
> それによりますと、センター内にある小保方リーダーらが使っていた冷凍庫の中から
> 「ＥＳ」と書かれたラベルを貼った容器が見つかり、中にあった細胞の遺伝子を詳しく
> 分析しました。
> その結果、この細胞には１５番目の染色体に緑色の光を出す遺伝子が入っている特徴の
> あることが分かったということです。
> 共同研究者の若山照彦山梨大学教授は１６日記者会見を行い、小保方リーダーが作製し
> たＳＴＡＰ細胞を培養したものだとする細胞を分析した結果、緑色の光を出す遺伝子が、
> １５番染色体に組み込まれていて、これまで若山教授の研究室で小保方リーダーがＳＴ
> ＡＰ細胞の作製に使っていたマウスの細胞とは特徴が異なることが分かったと発表して
> います。
> 今回の分析結果について理化学研究所は、「小保方研究室で見つかったＥＳと書かれた
> ラベルの細胞とＳＴＡＰ細胞から作ったという細胞の特徴が一致したのは事実だ。これ
> だけでＳＴＡＰ細胞がＥＳ細胞だったと結論づけることはできないが、今後さらに詳し
> く検証を進めていきたい」とコメントしています。

http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1403266477/8

12:  名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/06/20(金) 21:22:18.81

[STAP細胞が胎盤にも胎児にもなるという記載は笹井氏主導?]
http://ai.2ch.net/test/read.cgi/life/1397978711/677

2012/04/24　米国に仮特許出願US 61/637,631（以下「出願A」という）を行う
　　　　　　　　http://www1.axfc.net/u/3227005.pdf (← テキスト検索可能)
　　　　　　　　http://patentscope.wipo.int/search/docservicepdf_pct/id00000022851022.pdf
2012/12-01　★ここで笹井氏がプロジェクトに参加
http://ai.2ch.net/test/read.cgi/life/1401184889/13
2013/03/13　米国に仮特許出願US 61/779,533（以下「出願B」という）を行う
　　　　　　　　http://www1.axfc.net/u/3227009.pdf (← テキスト検索可能)
　　　　　　　　http://patentscope.wipo.int/search/docservicepdf_pct/id00000022881386.pdf

↑ここまで「STAP細胞が胎児にも胎盤にもなる」という記述はなく、
　↓ではじめて登場する(パラグラフ[0040]など)。さらに、笹井氏が発明者として追加されている。

2013/04/24　出願A,Bを優先権の基礎として、国際特許出願PCT/US2013/037996（以下「出願C」という）を行う。
　　　　　　　　http://www.google.co.jp/patents/WO2013163296A1
　　　　　　　　http://patentscope.wipo.int/search/docservicepdf_pct/id00000022883817.pdf
2013/10/31　出願Cが、公開番号WO2013163296として公開される

[特許出願書類中の記載事項の比較]
http://ai.2ch.net/test/read.cgi/life/1399735731/11

「胎児にも胎盤にもなる」 …… 出願C以降
「光る胎児と胎盤の画像」 …… 出願A・B・Cには含まれず (Letter が初出?)
「STAP幹細胞」 …… 出願C以降? (ただし、STAP細胞の培養についての記述は出願A・Bにもあり?)
「FI幹細胞」 …… 出願C以降?
「STAP幹細胞120日実験」 …… 出願C以降
「メスのSTAP幹細胞」 …… 出願A・B・Cには含まれず (Article が初出?)
「TCR再構成の確認」 …… 出願B以降 (Science 投稿論文が初出?)
「EpiSCとの比較実験」 …… 出願B以降
「博論からの画像流用」 …… 出願Aのみ (B・Cには含まれず、Article で復活。出願Aの時点で既に弱酸刺激処理の結果として不正流用)

http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1403266477/12

13:  名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/06/20(金) 21:23:19.07

【STAP細胞問題における笹井芳樹氏の時系列】

[2012年12月21日] 小保方氏の採用面接に参加
[2012年12月28日] 笹井版 Article 論文の叩き台作成 (8月にScienceに却下された論文を小保方氏が12月に改訂した物)
[2012年12月??日～] 小保方氏と共に Letter 論文の執筆開始 (小保方氏が若山研時代に得たデータを基に執筆) STAP細胞の胎盤への寄与等が初めて記載される?
[2013年01月??日] 丹羽氏の質問によりSTAP-SCでTCR再構成が無いことが判明。なお笹井氏はこれ以前に何故かその事実を把握済み。
[2013年03月10日] 笹井版 Nature 論文二編を投稿 (以降採録まで改訂・追加実験を繰返す)
[2013年03月01日] 小保方氏が CDB にユニットリーダーとして着任。以降、小保方ラボの立ち上げまで笹井研に間借り
[2013年04月24日] 発明者の一人として国際特許出願を行う。
　それまでに出願済みの2本の米国仮特許出願との相違点は
　1. 笹井氏が発明者として加わっている
　2. STAP細胞が胎児にも胎盤にもなるという主張を追加
　3. STAP-SC・FI-SCの記述を追加、等
[2013年05～09月?] 小保方氏が次世代シーケンサーによる解析を行う
　この解析データについては kaho 氏や複数の大学の研究チームによって疑義・不正が指摘されている。
[2013年08月??日] 若山氏から「責任著者から外して欲しい」との申し出を受けたがこれを慰留
[2013年10月??日] 小保方ラボ工事完了・立ち上げ
[2013年12月20日] 笹井版 Nature 論文二編の採録決定。上述の国際特許出願との相違点は
　1. 光る胎児と胎盤の画像
　2. メスのSTAP-SC
　3. 実験条件の異なる博士論文からの画像の不正流用、等
　光る胎児と胎盤の画像については、不可解な画像の誤用、また画像修正等の不正の可能性も指摘されている。
　そもそも光る胎盤の実物を確認した人はいない可能性もある。
[2014年01月28日] STAP細胞について記者発表
　「非常に説得力のあるデータが1個1個ある。でもちゃんと裏取りがされている。これは作ったような話ではできるものではない」等と発言
[2014年02月18日] 小保方氏から、博士論文からの画像流用を伝えられ、正しい実験結果との差し替えではなく、なぜか画像の撮り直しを指示
[2014年03～06月] kaho 氏や若山先生が依頼した第三者機関の解析結果を伝えられ「そんなもの意味は無い」と罵倒

http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1403266477/13

14:  名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/06/20(金) 21:23:58.82

【STAP細胞の胎盤寄与・STAP幹細胞・FI幹細胞の時系列】

2011年11月頃
　小保方氏・若山氏、STAP細胞の樹立、キメラマウスの作製に成功
　若山氏、STAP幹細胞 (STAP細胞の培養手法?) の樹立に成功
2012年4月24日
　米国仮特許出願 (US61/637,631)、STAP細胞の胎盤寄与、STAP/FI幹細胞に関する記述なし (ただし、STAP細胞の培養に関する言及あり?)
2012年06月頃
　[自己点検報告書によれば]
　　小保方氏、STAP細胞から胎盤形成に寄与する幹細胞 (FI-SCか?) を樹立する研究に取り組む
　　(ただし、実際にいつ樹立に成功したかは不明。
　　 また、STAP細胞が胎盤に寄与するかどうかの研究がいつ行われたかも不明)
　[記者会見での回答によれば]
　　STAP細胞の胎盤への寄与の確認およびFI幹細胞の樹立 (誰によって行われたか不明)
2012年06月～12月
　誰かがSTAP細胞で「胎盤が光る」と言い出し、小保方氏・または研究員同席のもとで写真撮影。
　ただし、ES細胞でも胎盤は光っていた。小保方氏が胎盤の切片を作成し、若山氏に「確かに胎盤は光っていた」と報告。若山氏は実物も画像も確認せず。
2012年12月頃
　笹井氏、研究プロジェクトに参画
2012年12月～13年03月10日
　笹井氏・小保方氏、若山研時代のデータを基にSTAP細胞が胎盤にも寄与するという Letter 論文を執筆・投稿
2013年03月13日
　米国仮特許出願 (US 61/779,533)、STAP細胞の胎盤寄与、STAP/FI幹細胞に関する記述なし (ただし、STAP細胞の培養に関する言及あり?)
2013年04月
　国際特許出願 (PCT/US2013/037996)、STAP細胞の胎盤寄与、STAP幹細胞、FI幹細胞等に関する記述追加
2013年05～09月
　STAP細胞、STAP幹細胞、FI幹細胞等をNGS解析にかける (→ 後にkaho氏らによって疑義が指摘される)
2013年12月
　Nature Article & Letter 論文採録決定、光る胎盤の画像、メスのSTAP幹細胞等に関する記述追加

http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1403266477/14

16:  名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/06/20(金) 21:25:12.69

小保方氏「研究室以外からの入手なし」　6月18日 12時24分

理化学研究所の小保方晴子研究ユニットリーダーは、ＳＴＡＰ細胞や実験に使われたとされる
マウスの遺伝子の分析結果などからＳＴＡＰ細胞の存在が疑われる不自然な点が相次いで
指摘されていることについて、

「マウスに関しても細胞に関しても私には所属させていただいていた研究室以外からの
　入手はありません」　などとしたうえで、今後、理化学研究所の調査に協力し、事実関係を
明らかにできるよう努めたいとするコメントを発表しました。

これは小保方リーダーが、１８日、代理人の三木秀夫弁護士を通じて発表したものです。

この中で、小保方リーダーは、共同研究者の若山照彦教授の側からマウスを渡され、
ＳＴＡＰ細胞を作製したはずなのにできた細胞がこのマウスのものではなかった点について

「マウスに関しても細胞に関しても私には所属させていただいていた研究室以外からの
　入手はありません」　などとしています。　そのうえで

「何よりもＳＴＡＰ細胞の再現・検証実験に参加させていただき、人為的な間違いが
　絶対に起きない環境でＳＴＡＰ細胞の存在を証明することで、筆頭著者としての
　説明責任を果たさせていただくことを切望しております」　としています。

また、小保方リーダーらが使っていた研究所の冷凍庫から「ＥＳ」と書かれたラベルの貼られた容器が
見つかり、中の細胞を調べたところ、ＳＴＡＰ細胞を培養したものだとされている細胞と目印となる遺伝子の
位置が一致した点については、弁護団による補足コメントとして

「小保方リーダーは、ＥＳ細胞を作製したことはなく小保方研究室に保管されているＥＳ細胞は
　　　　　　　　　　　　　^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
　若山研究室から譲与されたものです」　などとしています。
　^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
http://www3.nhk.or.jp/news/html/20140618/K10053066511_1406181237_1406181242_01.jpg
http://www3.nhk.or.jp/news/html/20140618/k10015306651000.html

http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1403266477/16

19:  名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/06/20(金) 21:26:35.01

【ポエム新作?】
http://wc2014.2ch.net/test/read.cgi/life/1403191068/96
96 ：名無しゲノムのクローンさん：2014/06/20(金) 02:26:30.44
　　CDB納涼会はoct3/4::GFP CD45で細胞ビンゴゲーム
　　司会はエキスパートだから加賀屋ホッピーオヤジだもん。
　　みんなまだ穴はあけないで、鼻もホジホジしないでね。
　　世界で一番大きな空気取り入れ口つきの花のリケジョになったらエア全開に
　　なっちゃった。
　　Teruは優しいからまだ教えてくれなかったけど、緑の眼の猫ちょっとオコ。
　　ゴッドハンド塚から発掘された一番不思議な謎細胞はoct3/4::GFP CD45。
　　性別詐欺はカリオタイピングで勝ったから（●●）マークをホジホジしてね、フン！
　　さらにさらに、oct3/4::GFP CD45謎万能細胞塊とTeruが作ったoct3/4::GFP ESで勝負。
　　GOF-GFP有り無し挿入部位はどちらもホジホジできるかな、さてさてほほー。
　　TCR,BCRリアレンジがどっちもなければ（●●）マークじゃなくて自分の鼻でもほじること。
　　謎細胞にリアレンジがあったら発現プロファイルでoct3/4とGFP強度を謎細胞とTeru ESでく
　　らべっこ。
　　結果は納涼会まで待っててね。自分の鼻ばかりほじって負けて鼻血ブー大会みんないやでしょ。
　　これからもシンデレラを応援してね。

http://wc2014.2ch.net/test/read.cgi/life/1403191068/885
885 ：名無しゲノムのクローンさん：2014/06/20(金) 11:06:42.39
　　どうして誰も五郎左さんを助けてあげないの？労災まっしぐらよ。
　　一番最初に白旗あげたしHPで手品ヒント公開したから罰ゲームなんて
　　ひどすぎる。
　　TCR、BCRリアレンジ万能細胞といえばiPSしかないけどさすがにこれは
　　ばれちゃうでしょ。だから一生懸命組織特異的デリーション酢風呂万
　　能細胞アイデアひねり出したわけ。マウス捌く振りしてほんとは受精卵
　　回収ES樹立中。組織特異的CreをONにしてエア記憶をESに植えつけるなん
　　て朝飯前。そろそろ朝飯だからシンデレラ食べにおいでと招待。
　　五郎左才能の超無駄遣い。
　　大丈夫、労災仕立てで壊れて再起不能になるよってシナリオありがとうね、
　　もう彼女だもん。

http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1403266477/19

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